2024年2月14日 星期三

SIMPLIFY CELL LINE DEVELOPMENT 簡化細胞株開發流程

 

Uno Single Cell Dispenser™ and Spark® Cyto multimode imaging reader to accelerate cell line development.

 

引言:

  單細胞株是單株細胞系開發中的關鍵步驟,應用範圍涵蓋治療蛋白生產、藥物篩選、基因治療以及探索細胞功能和疾病機制。確保細胞群體來源於單一細胞,對於避免產品品質和重組蛋白不穩定性的差異,提高實驗的重複性至關重要。細胞株的重要性在於它們能夠在不同實驗條件下為可靠和標準化的結果做出貢獻。

  限數稀釋法(limiting dilution)是一種常見的單細胞分選方法。它涉及將細胞稀釋至低濃度,以獲得每個孔基於泊松(Poisson)分佈的單一細胞。然而,有限稀釋固有地效率低下,大多數孔最終沒有細胞或有多於一個細胞。孤立單一細胞的最廣泛使用的方法是利用螢光活化細胞分選(FACS),但商業上可用的儀器復雜、昂貴,並可能影響細胞健康。

  本技術筆記描述了 Uno 單一細胞分配器用於孤立單一細胞的方法。該儀器利用微流體數字式分配技術,溫和地分離可行細胞,適用於各種下游應用,包括細胞系開發。通過添加能夠與細胞DNA結合的螢光染料,評估了 Uno 分配後的單一細胞的存活性,使用了 Spark Cyto 的全孔域螢光成像功能。使用 Uno Spark Cyto 兩者一同,實現了簡單的單一細胞孤立和單克隆細胞生長的確定,適用於各種下游應用。

 



1:使用Uno單細胞分配器和Spark Cyto的細胞系統發展工作流程。使用Uno單細胞分配器將單個HeLa細胞分離到96孔板中。在分配後1小時,通過螢光成像(CellTox Green Dye)確定細胞活力,並使用Spark Cyto的濃縮遮罩在分配後10天分析細胞生長。

 

材料和方法:

  哺乳動物細胞培養:HeLa細胞(DSMZACC 57)在DMEM培養基(DMEMGibco#41966-029)中培養,補充有10%的胎牛血清(FBSGibco#10270-098)、100 IU/ml青黴素和100 μg/ml鏈黴素(Sigma-Aldrich# P0781),在37°C5% CO2的細胞培養箱中培養。

  單一細胞分離:使用Uno單一細胞分配器和C1a Uno Dispensehead Cassette™(#30230841)芬提單個HeLa細胞。使用UnoControl軟體創建一個分配流程,使用與中等細胞大小(15-17 μm)相對應的流體類別,並將此流體應用於96孔板,以每孔分配一個細胞(圖2)。

 



2UnoControl軟體用戶界面。左圖:選擇中等細胞流體類別(15-17 μm)以分離HeLa細胞。右圖:將HeLa細胞流體應用於96孔盤。

  將約100個細胞/μl的細胞懸浮液重新懸浮在不含Mg2+Ca2+PBS中(Gibco,#10010-015)。120μl的懸浮液加入C1a Dispensehead Cassette,然後將細胞分配到80個含有200μl DMEM的孔中,DMEM中含有10 FBS和抗生素。對於細胞活力評估,向40個孔的培養基添加CellTox Green DyePromega,#G8741),稀釋1:500。對於陰性對照,培養基中添加了CellTox Green Dye(背景),對於陽性對照,播種了10,000個細胞,裂解並用CellTox Green Dye染色(根據製造商的建議)。

 

細胞活力和單細胞生長分析:

  使用Spark Cyto 600多功能光學影像分析儀(Tecan)進行單個細胞株和細胞活力評估的分析。在成像過程中,環境條件針對細胞進行了優化,將溫度設定為37°C,二氧化碳濃度調整為5%。在單細胞分配後的1小時、1天和10天,以2倍物鏡在明視野和綠色螢光成像模式下拍攝圖像。單細胞的活力是在細胞分配後的1小時進行評估的。將明視野和綠色螢光成像通道的圖像疊加使得能夠檢測螢光的死細胞。通過使用Spark Cyto的充實算法分析第10天的圖像,觀察細胞的生長。單細胞生長率是通過計算包含單一細胞株的孔數除以分配了單一細胞的總孔數來確定的。

結果:

  使用Uno進行的單細胞分離在96孔盤的80盤中實現了97%的分離成功率(圖3),總運行時間為248秒。在細胞分離後,使用Spark Cyto對孔進行了成像。使用2倍物鏡在單一視野中獲取整個孔的圖像。這使得在明場和螢光模式下快速高效地預覽樣品孔,優化焦平面和成像參數。分配後1小時的細胞活力為90%(40個孔中有4個孔包含死細胞)(圖4)。



3Uno實現的97%細胞分離成功率(第0天)。



4:基於螢光成像的注射後一小時的90%細胞存活率。

  在單細胞分離後的第1天和第10天掃描盤,以監測時間內的細胞群生長(圖5)。圖像使用Image Analyzer™中的confluence算法進行分析,以根據面積覆蓋率和表現外觀來識別表現最佳的細胞群。總體而言,確定了47%的細胞生長率。



5:使用整個孔域成像進行細胞群檢測。 Spark Cyto用於在96孔板中獲取整個明視野圖像,該圖像會自動使用Image Analyzer軟件進行分析,以識別細胞生長區域(黃色遮罩)。

 

結論:

  這裡描述的方法可以輕鬆適應各種研究和藥物開發應用,有助於推動新療法的發展以及我們對細胞過程的理解。本技術筆記突顯了Uno Single Cell DispenserSpark Cyto之間的協同作用,展示了它們在分離細胞、確保單株細胞性並對單個哺乳動物細胞群進行特性描述方面的優勢,用於細胞系的發展。

REFERENCES.

1) Andre Gross et al. Technologies for Single-Cell

Isolation. Int. J. Mol. Sci. 2015, 16(8), 16897-16919.

2) Elizabeth M. Llufrio et al. Sorting cells alters their

redox state and cellular metabolome. Redox

Biology, 2018, 16, 381-387.

3) Culture preparation for dispensing mammalian

cells, Tecan Protocol


原文

 https://www.tecan.com/uno



2023年12月6日 星期三

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以Nanoquant作螢光定量

Tecan Infinite® 200 NanoQuant是一個可以一次分析162ul的樣品的超微量樣品盤,上面具有16個獨立的樣品槽,每個都含有一對石英,因此它的光徑不會變,所以一生只需要校正一次(具出廠校正證明) ! 只要透過超音波振盪及壓縮空氣吹乾,即可回到符合校正後的狀態常規是透過70%酒精作使用前清潔。八個一排的配置(共兩排)便於使用八爪分注的客戶,分注兩次即能完成上樣。它能夠搭配Infinite® 200系列微量盤光度計,應用在吸收光與螢光偵測。



透過使用NanoQuant來定量Quant-iT PicoGreen標定的ds DNA,即使樣品量少至17pg dsDNA,也能被偵測的到。這是低於Quant-iT PicoGreen標榜的偵測極限25 pg (當樣品量為200ul)

NanoQuant
的使用,提升了Quant-iT PicoGreen染劑的偵測極限,著實為一個省時且可靠的偵測方式 !

這是怎麼一回事,請看看下面的測試報告!
Tris/EDTA (TE) buffer :
原始20X稀釋成1X使用,用於稀釋Quant-iT PicoGreenLambda DNA standard

Quant-iT PicoGreen :
使用TE buffer稀釋200x後使用
Lambda DNA standard :
使用TE buffer稀釋,配出Sample1~12(濃度依表1)

微量盤樣品配置:
50 ul Quant-iT PicoGreen + 50 ul Lambda DNA standard = 100 ul
50 ul Quant-iT PicoGreen+ 50 ul TE buffer=100 ul


NanoQuant使用前使用超音波清洗,並以壓縮空氣吹乾。使用i-control依表2作編程

 

NanoQuant樣品配置:

2 ul Quant-iT PicoGreen + 2ul Lambda DNA standard (濃度依表1)= 4 ul

4 ul混合後,再取2 ul點到NanoQuant樣品槽,每個濃度至少三重覆

搭配Infinite® 200系列微量盤光度計,使用軟體i-control依表2設定,NanoQuant作螢光偵測


測量結果:

NanoQuant測量顯示當dsDNA conc.= 0.9~1000ng/ml時的螢光讀值呈現良好線性(圖一)數據列於表3





使用濃度250 ng/ml樣品代表性的DNA濃度,再PicoGreenDNA定量螢光讀值計算它的偵測極限(敏感度:



可以得到偵測極限為8.7ng/ml dsDNA,當使用NanoQuant來測,樣品為2ul,約含17pg dsDNA (4)

Katy Yang

SIMPLIFY CELL LINE DEVELOPMENT 簡化細胞株開發流程

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